清水岩庙宇依山而筑,下临深壑,为三层楼阁式。一层昊天口,二层祖师殿,三层释迦楼。三层两边各有檀樾厅、观音厅、芳名厅。殿后有宋建清水祖师骨灰“真空塔”,上有新筑三重檐方亭。殿宇红砖墙、青灰瓦,危楼重阁,隐在青松翠竹、烟岚缭绕的山顶,典雅壮观。
岩宇附近有各具特色的景致:“狮喉”、“清珠帘”、“方鉴圹”、“枝枝朝北”、“罗汉松”、“觉亭”、“石栗柜”、“岩图碑刻”、“三忠庙”等。“清珠帘”,“一泓清水流千古,四望苍山垒万重”;“枝枝朝北”为古樟树,相传为感岳飞蒙难而枝杈北向;“岩图碑刻”系浮雕清水岩石全景碑了这株樟两岸信仰的清水祖师。
清水祖师流传于民间的传说,充满浓厚的神话色彩,反映百姓对祖师驱邪斗恶、济世行善的崇仰之心,首先是"试剑石"传说。说的是陈普足初筑清水,并不一帆风顺,常遇山鬼来扰,与争道场。一天,普足持剑,指对岩左险崖上的巨石,说一剑能叫巨石削分两半。山鬼不信,普足对准大石,把剑一挥,大石劈为两边,众鬼一见退避三舍。
安溪清水岩是台湾和东南亚众多清水祖师庙分灵去的祖庙,它们和安溪清水岩具有悠久的历史渊源关系。从明代以后,随着一批批安溪人纷纷迁移台湾和东南亚各地谋生,清水祖师的香火也传到那里。郑成功收复台湾时,队伍中有许多安溪人,他们身上带着“清水祖师公”的香火。
清康熙年间,由于安溪人文渊阁大学士李光地推荐施琅平定台湾和以后的林总兵镇台,施、林对安溪人有较大的关照,促使安溪人大批携眷渡台定居。随着安溪人移民的增加和村落的形成,清水祖师庙也陆续建造起来。凡是有安溪人聚居的地方,大多有清水祖师庙。清水祖师信仰成为台湾安溪移民维系各自群体团结的精神力量。
近几年来,台湾同胞来安溪清水岩祖庙拜谒进香的越来越多,他们到清水岩祖庙游览、进香,有的还题字留念。先后有台北景美会元洞清水祖师庙,台中县龙泉乡龙泉岩进香团、淡水清水岩进香团、淡水镇保安庙管委会等数十个团体到安溪清水岩寻根揽胜。
台北三峡礁溪里的苏万发等9人,专程拜谒祖庙,并在蓬莱山岩石刻下“溯本思源”作为纪念。从1987年至1990年台胞到祖师庙进香已达5万多人次,以后逐年增多,并恭请清水祖师神像300多尊到台湾供奉,表达他们对祖庙的崇敬之情,也表达他们热爱故土家乡的情怀。